棉棒的专业说法为咽拭子，一般咽拭子需涂抹到咽后壁、扁桃体隐窝和侧壁等部位提取标本，进行核酸检测。
目前进行核酸检测的方法主要是应用鼻咽拭子，经过口腔或鼻腔采集标本。如选择咽拭子在口腔内采集标本，被检测测者需将头略微后仰，张大嘴但不可长时间发出啊的声音，以免增加暴露风险。采样者将咽拭子深入被检测者的口腔内，越过舌根到达咽后壁和扁桃体隐窝、侧壁等部位，需轻轻反复擦拭3-5次，收集咽喉部的黏膜细胞。再将咽拭子放置到有裂解液的试管中保存。在取出咽拭子时，要避免咽拭子接触舌头、口腔黏膜、唾液等，以免影响检测结果的准确性。
通过咽拭子进行口腔采样时，检测前半个小时内应避免喝水，以免冲淡咽喉部的黏膜细胞，影响检测结果的准确性。检测前2小时内最好不要进食，以免使恶心、呕吐症状加重。